脑积水分流术后分流系统的阻塞是最主要的并发症。阻塞可以发生在分流系统的任何一个部位。可能因为血液，脑组织，肿瘤组织能堵塞，也可能因为自身连接问题而堵塞，或者由于儿童的成长等原因，导致分流管的位置变化而阻塞。
分流管堵塞表现出来的征象是颅内压的增高，如阵发性的头痛，恶心，呕吐，困乏以及智力的下降等，严重的可能发生意识丧失或昏迷。
那么，分流管堵塞怎么办呢？
如果这些情况发生医院就诊，外科医生会进行一些测试以明确堵塞部位，然后进行外科手术，对分流系统进行处理。
医院神外四科使用软性神经内镜解决分流管堵塞问题的案例：
患儿8岁，脑膜炎继发脑积水分流治疗5年后分流管梗阻
内镜右额入路全程探查分流管脑室段，见分流管与脉络丛关系密切但无粘连
分流管头端被透明隔包裹
分离被包裹的分流管
分流管复通
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