有些病原微生物可以穿过胎盘屏障直接作用于胚胎；有些微生物并非直接作用于胚胎，而是影响母体和胎盘，引起母体发热、缺氧、脱水、休克等或引起胎盘功能改变、胎盘屏障破坏，从而间接影响胚胎的生长和发育。
风疹病毒
风疹病毒是最早被发现的一种生物致畸因子。妊娠早期感染风疹病毒，约有15%～20%的胎儿出现白内障和心脏畸形，还可出现小头、小眼、先天性耳聋等畸形，妊娠中、晚期感染风疹病毒，可影响胎儿中枢神经系统和耳的功能发育。
巨细胞病毒
巨细胞病毒一般通过胎盘屏障直接作用于胚胎，感染时间越早，危险性越大。最常出现的畸形时小头、小眼、脑积水、先天耳聋、智力低下等。这种病毒在人群中感染率较高。
单纯疱疹病毒
常致小头、小眼、短指(趾)、心脏畸形、晶状体浑浊。脑积水、脑发育不全。此病毒在人群中感染率颇高。
弓形虫、梅毒螺旋体
梅毒螺旋体可破坏胎盘，直接感染胚胎，干扰胎儿发育，从而引起脑积水、牙齿畸形、先天性耳聋、智力低下等。宫内感染影响胎儿生长发育的具体机制因感染的病原微生物的不同而异。发热可抑制胎儿生长，甚至导致胚胎发育畸形。
药物
目前已有多种药物能引起人类胎儿生长发育迟缓，如乙醇、麻醉剂、苯巴比妥、叶酸拮抗剂、泼尼松等。甲氨蝶呤、6-巯基嘌呤、环磷酰胺等抗肿瘤药物可引起多种畸形。某些抗生素对胎儿发育有致畸作用，如四环素可引起胎儿牙釉质发育不全。孕期大剂量、长期注射链霉素，可干扰胚胎听器官的发育，出现先天性耳聋。妊娠早期，较长时间应用性激素，可干扰胚胎生殖系统的正常分化，甚至导致生殖系统的畸形。
烟和酒
孕期过量饮酒可引起多种畸形，称胎儿酒精综合征，其主要表现是发育迟缓、小头、小眼、短眼裂、眼距小、智力低下、心脏和关节畸形等。
吸烟可引起新生儿体重和身长降低，降低的程度与孕期吸烟的多少成正比。吸烟主要是由于尼古丁等物质使胎盘血管收缩，胎儿缺血缺氧，从而导致胎儿畸形。吸烟所产生的其他有害物质，如氰酸盐，也可影响胎儿正常发育。
为了胎儿的正常发育，孕期要杜绝以上因素哦。
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