山东白癜风医院 http://m.39.net/baidianfeng/a_4318885.html年，mNGS走入大众视野，新英格兰医学杂志（NEJM）刊登了一则病例：14岁联合免疫缺陷综合征男孩，年波多黎各旅行回国后因脑膜炎住院，发展为脑积水和癫痫状态。6周内进行38项感染病原检测，先后联用5种抗菌药物，未查出病因，尝试按照自免脑引起的昏迷状态治疗。48小时脑脊液宏基因组测序，检出圣地罗西钩端螺旋体序列条，改用青霉素治疗，32天后男孩痊愈出院。NEJM主编评论该报告的标题为“NGS，一个病例如何改变世界”，可见NGS的重要意义。随后，mNGS迅速被临床认可，年美国FDANGS感染性疾病诊断策略提出，mNGS可以用于微生物鉴定，检测是否耐药，是否是毒力标志物。目前，病原体高通量测序的临床适应症包括：疑难：不明原因感染诊断，病因排查；危重：重症肺炎、脑膜炎、脓毒症等；特殊：免疫低下人群，如移植患者、肿瘤患者等。mNGS的技术正随着社会的发展，在不断进步、完善。正确认识mNGS技术的局限和挑战与传统病原微生物检测相比，mNGS敏感性高，信息量大，但也存在一定的局限性。mNGS结果解读应注意什么？检出的病原体：只能代表标本中存在这些检出微生物，但不能确定是定植菌、背景菌还是致病菌。胞内菌/真菌检出率低：胞内感染菌因释放到体液中含量较少而导致检测敏感性偏低。另外，具有较厚细胞壁的病原体，其核酸提取效率较低，导致检出率和敏感性较低。RNA病原体的检测：RNA转录本身有更高的丰度和复杂度，又容易降解，对运输和保存的要求较高，因此RNA病毒的临床检测还存在一定的困难。可靠程度：不同的公司，对于可靠程度的数据采用不同的报告方法，如深度、覆盖度、丰度、估测浓度、置信度，各有千秋，需要统一。最重要的参数需谨记：病原体，序列数。reads数的高与低意味着什么？reads指的是匹配到该病原体的序列数目，reads高不一定意味着致病，reads数低不一定意味着不致病，数的多少与标本中病原体含量多少、标本中核酸提取量及标本中人源序列比例有关。不同的病原体，具有不同的reads数特点，单个病原体逐个分析至关重要。结合reads数目、病原体排位，临床才能更好的进行分析。合理报告，注意区分背景菌老年男性，因“流感”1周入住呼吸ICU，PCR确诊重症甲流肺炎，治疗好转，第5天再次发热，病情加重，考虑继发曲霉感染，经验性抗曲霉治疗。诊断是否成立？经验性治疗合理吗？检查GM试验，血清GM3.81，BALFGM4.34，高度拟诊，但所有标本培养无真菌生长。此时BALFmNGS结果汇报，检测到烟曲霉，诊断成立，继续治疗痊愈。因此，mNGS报告时要注意以下三个要点：是否是致病病原体或条件致病病原体；人体正常存在微生物，在免疫缺陷等特殊患者中值得
转载请注明：http://www.hjmgt4000788781.com/njsss/8962.html
